마포교회는 모든 사역의 중심을 예배에 두고 있습니다.
주일 예배는 4부로 드리고 있으며 마지막 4부예배는 청년예배로 드립니다. 이외에 주일 오후예배와 직장인을 위한 수요정오예배를 드리며 수요기도회, 새벽기도회, 금요심야기도회를 통하여 성도들의 영성을 도모하고 있습니다.
복음중심의 교회교육이 될 수 있도록 최선을 다하고 있습니다. 유아 유치부, 유년부 소년부, 중고등부, 청년1,2부로 구성된 교회학교는 100여명의 열심있는 교사들이 각 부서 예배실에서 최고의 말씀교육을 하고 있습니다. 또한 장년 성도들을 위하여 다양한 성경공부 과정을 개설해 두고 있는데 벧엘성서, 중보기도학교, 인물성경공부 등을 통해 말씀 중심의 성도들을 양육하고 있습니다.
교회의 사회적 책임을 절실히 느껴왔었기에 사랑의 이삭줍기운동, 폐지수집, 바자회 등을 통해 거택 보호자, 무의탁 노인들을 돌보고 있으며, 장기기증운동, 소년소녀 가장 돕기, 방과후 학교 등을 통해 지역 사회의 교육에 관심을 갖고 있습니다. 뿐만 아니라 하나님이 주신 창조질서 보전을 위해 환경운동에도 앞장서는 교회가 되려 합니다.
전국 11개 미자립 교회와 중국 흑룡강성 활빈 남강구 교회, 중국 흑룡강성 기독교 신학교,중국 길림성 변방교회를 돕고 있으며, 러시아와 북한 선교를 위해 최선을 다하고 있습니다.
경찰청 교회, 마포경목위, 성경구락부,대한기독교 문화진흥원, 지하철 공덕역 선교를 통해 기관선교에도 앞장서고 있습니다.
조선족 선교를 위해 조선족 목사 1명, 평신도 사역자 1명을 초청, 장신대에서 공부할 수 있도록 학자금 전액을 지원하고 있습니다.